当前位置:首页 >> 美食 >> 正文

AI助力预测细菌抗生素抗性基因

我要评论来源:平顶山新闻网 2020/2/14 8:36:11 

《自然-通讯》报道,加州大学的研究人员开发出一种方法,利用识别和预测使传染性细菌产生抗生素抗性的基因。利用该方法在结核分枝杆菌上进行,鉴定出了33种已知和24种新的抗生素抗性基因。

AI助力预测细菌抗生素抗性基因

研究者表示,了解哪些基因赋予抗生素抗性可能会改变未来传染病的治疗方式,例如,如果临床上持续感染结核病,医生可以对该菌株进行,查看其基因并确定哪些抗生素有效,然后为该菌株开出个性化的抗生素处方。

该团队使用大量基因组序列和对应表型进行训练,该算法就可以预测一组基因是否会导致抗生素抗性。研究发现了结核杆菌的33个已知的和24个新预测的抗生素抗性基因,目前正在测试该算法预测的24个新基因是否确实赋予结核分枝杆菌抗生素抗性。研究者进一步分析了该算法的预测,并确定了可能相互作用并使菌株具有抗生素抗性的等位基因组合。他们还将这些等位基因定位于结核分枝杆菌蛋白质的结构上。他们发现有些等位基因聚集在蛋白质的某些结构区域。研究者进行了相互作用和结构分析,挖掘这些基因如何对抗生素抗性表型产生影响。

研究者下一步将机器学习方法应用于其他传染性细菌。该团队正在将代谢网络的基因组模型与其机器学习方法结合,以探究抗生素抗性进化的潜在机制。


相关阅读:
cjo54.cn cjo54.cn
分享到: